Atlas → AJAX への Migration Guide （July CTP 以前と Control Toolkit）
ScottGu's Blog と
Shawn Burke's Blog からです。
ASP.NET AJAX Beta 1 Released
Atlas Control Toolkit -> AJAX Control Toolkit Migration Guide
AJAX Control Toolkit Migration Guide
Atlas から Microsoft "AJAX"へと変化した過程で、atlas:～～ から asp:～～ へと変化したり、dll が無くなったりと、内部的に大きく変化している部分があります。
既存の CTP で作成されているアプリケーションと大きく異なるので、既存の CTP で作成されているアプリケーションのマイグレーションが出ています。移行の必要性がある方は読んで参考にしてください。
私も余力があれば注意点等をまとめたいと思います。
（注）Scott さんの Blog では直接マイグレーションの事は書かれていません。 Next Step の部分にある You can read a migration guide with the details on how to-do this here. からダウンロードをしてください。